Sejak berdirinya Pondok Pesantren Al-Haromain yang berfokus pada pelajaran Al-Qur’an dan kitab, Pondok Pesantren membuka kerja sama dengan Dinas Pendidikan melalui SMP/SMA Terbuka. Setelah beberapa tahun berlalu, ada beberapa kendala yang di jumpai, sehingga pendiri Pondok Pesantren dan di dukung oleh keluarga berinisiatif untuk membuka pendidikan formal.
Madrasah Aliyah Barokah Al-Haromain berdiri pada tahun pelajaran 2007/2008 yang di kepalai langsung oleh KH.M. Dainawi. Seiring berjalannya waktu, Madrasah Aliyah Barokah Al-Haromain terus berbenah hingga pada tahun 2016 telah terakreditasi B. Pada Tahun 2016 Ahmad Mujtaba, S.TH.I, S.E ditunjuk oleh Yayasan menjadi Kepala Madrasah. Melihat perkembangan zaman dan kepercayaan masyarakat terhadap Yayasan Pondok Pesantren Al-Haromain, berjarak 2 tahun kemudian tepat tahun 2009 didirikannya Madrasah Tsanawiyah Barokah Al-Haromain dibawah kepemimpinan Ibunda Hj. Nurkamawati, S.Pd. Pada Tahun 2018 telah terakreditasi B. Pendirian pendidikan formal MA dan MTS ini dengan niat untuk mendukung dan memudahkan para santri dalam mengikuti program pemerintah wajib sekolah 12 tahun. Hingga saat ini MA dan MTs Barokah Al-Haromain sudah meluluskan lebih kurang 1000 santri.
Secara geografis, MA dan MTs Barokah Al-Haromain terletak di daerah pedesaan pegunungan, tepatnya di Komplek Pondok Pesantren Al-Haromain Desa Pulau Panggung, Kecamatan Semende Darat Laut. Dominasi mata pencaharian penduduknya adalah petani, dimana dominannya adalah perkebunan kopi, karet, dan persawahan. Dalam observasi kami, keseluruhan penduduk beragama Islam. Demi keberlangsungannya pendidikan pada tahun 2016 didirikan pula Madrasah Ibtidaiyah Barokah Al-Haromain dibawah kepemimpinan H. Aunu Athaillah, S.HI. Pada tahun 2019 telah terakreditasi C. Program unggulan dari MI Barokah ini adalah Tafiz Qur’an. MI Barokah Al-Haromain berlokasi di Desa Talang Gudang Kecamatan Semende Darat Laut Kabupaten Maura Enim Sumatera Selatan.
Madrasah Aliyah, Madrasah Tsanawiyah dan Madrasah Ibtidaiyah Barokah Al-Haromain adalah institusi pendidikan formal jenjang menengah atas, menengah pertama dan sekolah dasar berciri Islam yang yang berdiri di bawah naungan Pondok Pesantren Al-Haromain. Berbekal itulah maka program pengajaran di MA dan MTs Barokah Al-Haromain diarahkan agar peserta didik ketika lulus siap untuk mengembangkan ajaran-ajaran islam baik secara tekstual dan kontekstual di masyarakat, menjadi garda terdepan dalam pengamalan kegiatan keislaman yang saat ini tetap terjaga dengan baik di daerah Semende Raya. Selain itu, tentu saja diharapkan setiap peserta didik memiliki dua semangat setelah lulus dari pendidikan formal Barokah Al-Haromain, yaitu semangat berkarya dalam dunia ekonomi dan belajar sepanjang hayat. Dua bekal semangat tersebut, diyakini dapat memacu tumbuh kembangnya daerah Semende ke depan.
Visi dan Misi MA-MTS-MI Barokah Al-Haromain ini secara garis besar adalah “Mencetak generasi berakhlakul karimah, berilmu dan beriman”.